Die Geschäftsleitung steht der Gemeindeverwaltung vor. Sie koordiniert die operativen Aufgaben der Gemeindeverwaltung, bereitet Geschäfte für den Gemeinderat vor und klärt wichtige Personal- und Führungsfragen. Die Geschäftsleitung bildet das Bindeglied zwischen der strategischen Ebene des politisch gewählten Gemeinderates und der operativ tätigen Gemeindeverwaltung. Die Geschäftsleitung tagt in der Regel alle zwei Wochen und fällt im Rahmen ihrer Zuständigkeiten, Kompetenzen und Verantwortlichkeiten die diesbezüglichen Entscheide. Die Aufgaben und Kompetenzen sind im Geschäfts- und Kompetenzreglement der Gemeinde Fislisbach geregelt.