Die Gemeindekanzlei ist das Sekretariat des Gemeinderates und Anlaufstelle für allgemeine Anfragen, welche nicht einer anderen Abteilung zugeteilt sind. Hier werden die Gemeinderats- und Gemeindeversammlungsbeschlüsse bearbeitet, Wahlen und Abstimmungen vorbereitet, Gemeindeanlässe organisiert, Einbürgerungsgesuche behandelt und Unterschriften beglaubigt. im weiteren ist das Personal der Gemeindekanzlei für die Bewirtschaftung der Homepage der Gemeinde Fislisbach zuständig. Der Gemeindekanzlei ist das Bestattungsamt angegliedert.